1595: La primera iglesia que albergó al Cristo fue la Parroquia de Santiago, construida a finales del siglo XVII.

1740: Comienza la edificación del nuevo Santuario, por orden de Fray Pedro Pardo de Figueroa

1759: Termina la construcción del templo. Se celebran los ritos de bendición y se traslada la imagen.

1835: Se elaboran el pórtico de plata del camarín y el frontis.

1861-1872: Se emprenden restauraciones por daños, colocación de los ocho altares, adorno, retablos, pinturas e imágenes.

1873-1885: Se mandan a pintar varios cuadros murales del artista guatemalteco Pascasio González y se construyen las cúpulas de los cuatro campanarios.

1905-1907: Se renueva la cúpula central y se recubre de azulejos.

1951: 16 de diciembre se consagra la Basílica.

1961: El 27 de enero el papa Juan XXIII eleva el Santuario a la dignidad de Basílica Menor.

1993-1994: Se efectúan trabajos de restauración y conservación de las imágenes, a cargo del IDAEH.

1996: El Papa Juan Pablo II preside la celebración del Cuarto Centenario del Cristo y visita la Basílica

2009: Se celebra el Año Santo Jubilar por el 250 aniversario de la Basílica.